一九九○年，黨中央、國務院做出決定，要加快上海浦東地區(qū)的發(fā)展和開發(fā)，在浦東實行經(jīng)濟技術(shù)開發(fā)區(qū)和某些經(jīng)濟特區(qū)的政策。在國家給予浦東新區(qū)的十項優(yōu)惠政策中，允許在浦東新區(qū)內(nèi)設立保稅區(qū)，即外高橋保稅區(qū)。
國家規(guī)定允許保稅區(qū)內(nèi)外商機構(gòu)為區(qū)內(nèi)外商投資企業(yè)代理本企業(yè)生產(chǎn)用原材料、零配件進口和產(chǎn)品出口業(yè)務。為便于管理，保稅區(qū)進出口貨物時，海關(guān)憑貿(mào)易和生產(chǎn)企業(yè)簽訂的代理進口合同及其他有關(guān)單證驗放。
對從境外進口供保稅區(qū)基礎設施及生產(chǎn)使用的機器、設備、基建物資、生產(chǎn)用車輛、交通工具和辦公用品；為加工出口產(chǎn)品而進口的原材料、零部件、元器件、包裝物料；供儲存的轉(zhuǎn)口貨物、以及在保稅區(qū)加工運輸出境的產(chǎn)品免領(lǐng)進出口許可證，免征關(guān)稅和工商統(tǒng)一稅。保稅區(qū)與非保稅區(qū)之間的貨物來往，按現(xiàn)行國家對進出口貨物的政策規(guī)定辦理。
保稅區(qū)內(nèi)生產(chǎn)項目應符合國家產(chǎn)業(yè)政策的規(guī)定，屬于國家限制、控制發(fā)展的行業(yè)與項目應經(jīng)國家主管部門批準。保稅區(qū)僅設立行政管理機構(gòu)及有關(guān)企業(yè)，除安全保衛(wèi)人員外，其他人員不得在保稅區(qū)內(nèi)居住。
保稅區(qū)與非保稅區(qū)分界線設置完善的隔離設施，進出保稅區(qū)的貨物、運輸工具和個人攜帶物品，心須由設有海關(guān)機構(gòu)的出入口進出，并向海關(guān)申報，接受海關(guān)檢查。不能利用國家給予保稅區(qū)的優(yōu)惠和便利條件進行走私、違規(guī)活動。
保稅區(qū)進口貨物不能認為是自由進出。因為不論是國際上建立的同類保稅區(qū)還是浦東（中國上海）外高橋保稅區(qū)都存在著一定的管理問題。第一，給予保稅區(qū)的優(yōu)惠和便利措施僅限于進口運入保稅區(qū)加工的原材料、零部件以及運入保稅區(qū)轉(zhuǎn)口的貨物，而不是所有進口貨物。運往非保稅區(qū)就與一般進口貨物一樣需領(lǐng)取進口許可證并辦理征稅手續(xù)。第二，同家禁上進出口的貨物、物品也不得運入、運出保稅區(qū)。第三，進出口保稅區(qū)的貨物都要向海關(guān)申報并依據(jù)報關(guān)單編制進出口海關(guān)統(tǒng)計。
從非保稅區(qū)運入保稅區(qū)應該按照出口貨物的有關(guān)規(guī)定辦理海關(guān)手續(xù)。屬許可證管理的商品應申領(lǐng)出口許可證，該繳納出口關(guān)稅的就要繳稅。
保稅區(qū)進口的貨物應限于保稅區(qū)內(nèi)使用，保稅區(qū)企業(yè)加工生產(chǎn)的產(chǎn)品應全部銷往國外，上述貨物和產(chǎn)品未經(jīng)批準不得轉(zhuǎn)讓、銷售到非保稅區(qū)。批準后轉(zhuǎn)讓、銷售到非保稅區(qū)的，也要按照規(guī)定申領(lǐng)進口許可證并照章征稅。

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